Al iniciarse el régimen colonial en el siglo xvi en lo que es actualmente nuestro país, México, los Altos de Jalisco no existían como tales. Precisamente la formación de una región con ese nombre en el actual estado de Jalisco se inició al momento en que los españoles intentan avanzar hacia el norte y el occidente, una vez que se han establecido en la destruida Gran Tenochtitlán y han fundado los cimientos de la actual Ciudad de México. Fundada la ciudad de Guadalajara y establecida allí la Audiencia de la Nueva Galicia, es esta institución la que controló administrativamente el poblamiento del vasto territorio que se abría hacia el norte de nuestro país.